Dans ses efforts constants aux niveaux humain, social et éducatif, Abouna Yaacoub rêve d’ériger une imposante Croix sur l’une des collines, après avoir vu, appréhendé et vécu les catastrophes et les tragédies qui ont frappé le Liban lors de la première guerre, lorsque des dizaines de milliers de Libanais sont exilés, morts de faim ou pendus, sans qu’une croix ne soit surplombée sur leurs tombes. 

Et dans sa quête d’un emplacement, un monticule à Jall-Eddib, où se trouve un petit couvent de trois pièces, attire l’attention d’Abouna Yacoub. Le nom de ce monticule était «Arid Silwane», et certains l’appelaient «la Colline des Djinns». Il l’acquiert le 25 août 1919… Ainsi, Abouna Yaacoub commence par excaver la route de Jall-Eddib jusqu’au sommet de la montagne, puis il prépare le terrain pour le rendre propice à la construction. En 1921, la première pierre est bénie. 

 L’édifice commence à prendre forme, l’église est construite d’abord pour être dédiée par Abouna au nom de Notre-Dame de la Mer et elle est inaugurée le 3 mai 1923. Ce site deviendra un lieu de rassemblement pour les membres du Tiers Ordre, ainsi qu’un lieu de prière à l’intention des victimes de la guerre et des expatriés. L’achèvement du projet est couronné par l’érection d’une grande Croix en fer, de 10 mètres de hauteur, et portant le Crucifix, a été érigée du côté ouest de l’église. Ainsi avec l’élévation de la Croix, Abouna Yaacoub voit-il son rêve se réaliser sur cette terre.

Au centre de l’église-sanctuaire se dresse la statue de Notre-Dame de la Mer qui représente la Vierge portant l’enfant Jésus et à ses pieds un navire embarqué par des voyageurs et des émigrants. Abouna Yaacoub a voulu placer ces voyageurs sous la protection de la Vierge Marie, pour qu’elle les ramène sains et saufs à leur patrie. Il a aussi mentionné cette intention dans de nombreux prières et cantiques qu’Il a composés. Jusqu’à nos jours, les religieuses mettent sous sa protection tous les Libanais de la diaspora épars dans les quatre coins du monde; comme elles continuent à célébrer la fête de Notre-Dame de la Mer, le 03 mai de chaque année.

L’église abrite une toile d’huile de Notre-Dame, patronne du sanctuaire, en face de laquelle trône une autre toile d’huile peinte délibérément à l’occasion de la béatification d’Abouna Yaacoub en l’an 2008, illustrant la mission et les objectifs de la Congrégation des Franciscaines de la Croix du Liban: prendre soin des prêtres, porter une attention particulière aux malades mentaux et psychiques tel que les religieuses qui s’occupent des vieilles gens, des marginaux, des aveugles, des orphelins et des enfants démunis. À droite de l’autel, se trouve une relique des ossements du Bienheureux Abouna Yaacoub. 

À l’intérieur du sanctuaire, à droite de l’entrée, se trouve la tombe du Bienheureux Abouna Yaacoub, occupant un endroit imbu de ferveur, et dont le silence est transpercé par une douce musique appelant le visiteur à la méditation et à la prière.

Le deuxième étage transformé, à l’occasion de la béatification, en un musée propre au Bienheureux Abouna Yaacoub, comprend sa librairie personnelle, sa chambre à coucher, ses fournitures personnelles, les objets utilisés de ses propres mains, les tenues liturgiques, des ustensiles sacrés, ses diplômes et décorations, son chapelet dont la Croix en bois est usée par ses doigts, le cercueil en bois qui comprenait sa dépouille en 1954, les récipients à eau dans lesquels ont été lavés les ossements du Bienheureux, et des ustensiles mis en usage le jour de la mise en examen des détails de son corps. 

À la sortie du sanctuaire, le visiteur s’attarde devant la statue en bronze d’Abouna Yaacoub, une exposition pour les souvenirs, les imprimés et les publications. Si le visiteur souhaite allumer des cierges et affirmer ses intentions, un endroit est créé spécifiquement à cette fin.

Le visiteur circule l’enceinte du couvent de la Croix, avec ses parvis spacieux, et visite la Croix donnant sur la montagne et le littoral. Comme il peut visiter l’église du Calvaire telle que bâtie par Abouna Yaacoub et qui abrita sa dépouille durant de nombreuses années. 

Des milliers de libanais, résidents et expatriés, visitent le sanctuaire, soit pour invoquer l’intercession d’Abouna Yaacoub, soit pour prier au pied de la Croix et devant la Vierge Notre-Dame de la Mer, soit pour puiser leur bénédiction dans le lieu saint.